日本近些。从尼日利亚的地理位置就能看出。
尼日利亚联邦共和国，位于北纬06°27′，东经03°24′，处于西非东南部的国家，非洲几内亚湾西岸的顶点，邻国包括西边的贝宁，北边的尼日尔，东北方隔乍得湖与乍得接壤一小段国界，东和东南与喀麦隆毗连，南濒大西洋几内亚湾。尼日利亚国土面积92.38万平方公里，海岸线长800公里。
很开心能回答你的这个问题！
首先我们要搞清楚尼日利亚在非洲！而马来西亚和日本都属于亚洲，本质来说都很远！
然后我们来判断马来西亚到尼日利亚(两国地理中心)的直线距离(飞行路线)为10295公里(6397英里或5559海里)。
而日本到尼日利亚的距离 12729公里
这样就可以直观的看出来日本离尼日利亚选一些
马来西亚离得近。
尼日利亚是非洲第一人口大国，总人口2.01亿[1]，占非洲总人口的16%，同时也是非洲第一大经济体，2013年，尼日利亚国内生产总值（GDP）5099亿美元。
尼日利亚是非洲能源资源大国，是非洲第一大石油生产和出口大国。截止2014年已探明石油储量居非洲第二、世界第十；已探明天然气储量居非洲第一、世界第八；已探明76种矿产中有34种具备商业开采价值。
应该是马来西亚离尼日利亚更近一些，日本在亚洲的东部，虽然地球是圆的的，但无论从那个方向上看距离离非洲的尼日利亚都比较远，而马来西亚在南亚地区，相对来说属于地球的中部，在距离非洲的尼亚利亚来说比日本的距离会更近一些
